fit

N 报告树N的总拟合度。它是用凸增函数（convex icreasing function）测量的，要最小化！

!N 同，将分支优化为软多分支（polytomies）。

*N 报告总适合度（用凹形下降函数衡量，最大化；与PAUP*和Pee-Wee报告的等效）。

fillsank

= Sankoff 性状的完整多态表格（polymorphic cells ）。

- 不要这样。

; 报告现有约束

] 停用约束

= 跟树，在树中使用组（&N使用树N）

/ 跟树，在树中使用树作为骨架树（&N使用树N）（如果排除外群，则它起到“凸性”约束）

： 与/相同，但对于负约束

+ 正约束：[a b c（d e）]（d和e浮动；如果排除外群，则起到“凸性”约束）。

- 与+相同，但是负约束

>N taxa N 对于所有正约束浮动

<N 与>相同，适用于所有负约束

* 报告与每个约束对应的数字

正约束永远应该先于负约束

force +[:Genus1][:Genus2] -[:Outgroup1 :Outgroup2];

计算频率差异树（FDT）

=N 使用N作为截止值

N/L 显示不包括样本 L 的树 N 的FDT

[J]N/L 计算在一组/个树 N 上对树 J 的每个组的频率差异，并且是在修剪样本 L

(J)N/L 一样，但是显示为表格

*N/L 一样，但是保存FDT为内存里最后一个树

&N/L 展示并且保存FDT为内存里最后一个树