TNT:U
unique
丢弃重复的树(不折叠)
*
先折叠然后丢弃重复项。
=
在计算共识时从树中修剪未共享的分类单元(默认)。
-
不。
usminmax
N =M
设置(sankoff)性状N
到M
的最小步数。(如果为 0,则为指定的性状关闭用户最小值)。
*
将 sankoff 性状的用户最小值保存到日志文件,其格式可以随后输入到 TNT 中。
!
使用树搜索确定每个 sankoff 性状的用户最小值。 这是针对当前成本和 ancstates
设置的;如果这些设置中的任何一个发生变化,建议重复计算。
+M N
将 Sankoff 性状N
到M
的最大状态数设置(在优化中,即使在终端中不存在,也要尝试这些状态)。这不适用于对应于始终使用实际最大值的性状状态树的 sankoff 性状。可以为不同的性状定义不同的最大值,并且可以使用下一个选项统一打开/关闭。当用+
定义最大值时,它们最初是活跃的。
[
如果用户定义了最大状态,应用它们。
]
不要应用用户最大状态(不过,保留定义,以便可以使用 ]
再次打开它们)。