edit

X Y 编辑树X的节点Y。

X Y J L 然后，将J发送到节点L。如果J是L的祖先，则将J的支系重置根于L。

/N 折叠节点N（这可以给出为列表，节点以“+”分隔）。

echo

= echo 每个命令

- 不 echo

[ 如果日志文件已打开并从控制台接收命令，则将控制台输入回显到日志文件中。

] 不这样做

以NEXUS格式导出数据。如果文件名后跟“+”，则将所有内容复制到NEXUS文件的末尾，直到找到分号（将其用于在文件中嵌入PAUP *或TNT命令）。 TNT命令可以包含在文件末尾，前面是begin tnt.。

可能的参数（文件名前）：

* 树也包含

+ 步幅矩阵

- 仅树（包括树标记，如果定义

> 仅树标记，作为分支长度

< 仅树标记，作为分支标签

[ 保存为dna

] 保存为离散数据

! 保存为Fasta而不是Nexus（跳过gap

= 仅保存树，纯Newick

| 以TPS格式保存。语法是：export | filename C T;这将保存至文件性状（=地标配置），包括树T的祖先状态（仅在指定T可选时）。