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==环境== [https://github.com/ddarriba/jmodeltest2 下载地址],必须在java环境下运行。 ==使用== 菜单栏<code>File</code> > <code>Load DNA Alignment</code>选择你的文件。 菜单栏<code>Analysis</code> > <code>Compute Likelihood Scores</code>,因为用不到太多模型,也为了提高速度,将<code>Number of Substitution Schemes</code>改为<code>3</code>再点击<code>Compute Likelihoods</code>。 菜单栏<code>Analysis</code> > <code>Do AIC calculations</code>全选后点击<code>Do AICc calculations</code>选择ML的最适模型。 菜单栏<code>Analysis</code> > <code>Do BIC calculations</code>全选后点击<code>Do BIC calculations</code>选择BI的最适模型。 菜单栏<code>Results</code> > <code>Show Results Table</code>根据AICc和BIC查看最适模型。 菜单栏<code>Results</code> > <code>Build HTML log</code>保存文件。 [[分类:Bioinformatics]]
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